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論文・著書情報


タイトル
和文:タンパク質の特性に基づくunboundドッキングのための剛体予測手法の改良 
英文:Improvement of rigid-body prediction for unbound docking based on protein feature 
著者
和文: 松崎裕介, 大上雅史, 松崎由理, 佐藤智之, 関嶋政和, 秋山泰.  
英文: Yusuke Matsuzaki, Masahito Ohue, Yuri Matsuzaki, Toshiyuki Sato, Masakazu Sekijima, Yutaka Akiyama.  
言語 Japanese 
掲載誌/書名
和文:研究報告バイオ情報学（BIO） 
英文:IPSJ SIG Technical Report 
巻, 号, ページ Vol. 2010-BIO-20    No. 4    pp. 1-8
出版年月 2010年2月25日 
出版者
和文:情報処理学会 
英文: 
会議名称
和文:情報処理学会 第20回バイオ情報学研究会 
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開催地
和文:石川県 
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公式リンク https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/ej/?action=pages_view_main&active_action=repository_view_main_item_detail&item_id=68043&item_no=1&page_id=13&block_id=8
 
アブストラクト 我々が開発するタンパク質間ドッキング予測システム MEGADOCK において，そのドッキングスコアを算出する目的関数は形状の相補性と静電的相互作用を反映しているが，それぞれの項の重みは対象タンパク質によらず一定である．しかしタンパク質の形状やドッキングにおける構造変化に多様性があるため，目的関数におけるその重みをタンパク質の特性に応じて変化させることにより，予測精度の改善が期待できる．本研究では，溶媒露出面積や表面電荷，溶媒中の構造変化などの個々のタンパク質の特性に基づいて静電重みを決定し，目的関数における形状相補性の寄与を変えることで，unbound ドッキングの予測精度を向上させる方法を提案する．

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