論文

• Richard Archer, Shogo Hamada, Ryo Shimizu, Shin-Ichiro M. Nomura. Scalable Synthesis of Planar Macroscopic Lipid-Based Multi-Compartment Structures, Langmuir, Vol. 39, No. 14, pp. 4863-4871, Apr. 2023.  公式リンク  
  
• Yehudah A. Pardo, Kenneth G. Yancey, David S. Rosenwasser, David M. Bassen, Jonathan T. Butcher, Jenny E. Sabin, Minglin Ma, Shogo Hamada, Dan Luo. Interfacing DNA hydrogels with ceramics for biofunctional architectural materials, Materials Today, Vol. 53, pp. 98-105, Mar. 2022.  公式リンク  
  
• Shogo Hamada, Luo, D.. Enzyme-based fabrication of physical DNA hydrogels: new materials and applications, Polymer Journal, Vol. 52, No. 8, pp. 891-898, 2020.  公式リンク  
  
• Derrien, T.L., Shogo Hamada, Zhou, M., Smilgies, D.-M., Luo, D.. Three-dimensional nanoparticle assemblies with tunable plasmonics via a layer-by-layer process, Nano Today, Vol. 30, 2020.  公式リンク  
  
• Wang, D., Cui, J., Gan, M., Xue, Z., Wang, J., Liu, P., Liu, P., Hu, Y., Pardo, Y., Shogo Hamada, Yang, D., Luo, D.. Transformation of Biomass DNA into Biodegradable Materials from Gels to Plastics for Reducing Petrochemical Consumption, Journal of the American Chemical Society, Vol. 142, No. 22, pp. 10114-10124, 2020.  公式リンク  
  
• Liao, R., Zhao, F., Shogo Hamada, Yang, P., Xu, H., Luo, D., Yang, D.. DNA-based engineering system for improving human and environmental health: Identification, detection, and treatment, Nano Today, Vol. 35, 2020.  公式リンク  
  
• Shogo Hamada, Yancey, K.G., Pardo, Y., Gan, M., Vanatta, M., An, D., Hu, Y., Derrien, T.L., Ruiz, R., Liu, P., Sabin, J., Luo, D.. Dynamic DNA material with emergent locomotion behavior powered by artificial metabolism, Science Robotics, Vol. 4, No. 29, 2019.  公式リンク  
  
• Kandatsu, D., Cervantes-Salguero, K., Kawamata, I., Shogo Hamada, Nomura, S.-I.M., Fujimoto, K., Murata, S.. Reversible Gel–Sol Transition of a Photo-Responsive DNA Gel, ChemBioChem, pp. 1118-1121, 2016.  公式リンク  
  
• Cervantes-Salguero, K., Shogo Hamada, Nomura, S.-I.M., Murata, S.. Polymorphic ring-shaped molecular clusters made of shape-variable building blocks, Nanomaterials, Vol. 5, No. 1, pp. 208-217, 2015.  公式リンク  
  
• Kim, J., Lee, J., Shogo Hamada, Murata, S., Ha Park, S.. Self-replication of DNA rings, Nature Nanotechnology, Vol. 10, No. 6, pp. 528-533, 2015.  公式リンク  
  
• Shogo Hamada, Tan, S.J., Luo, D.. Nanoparticle crystallization: DNA-bonded 'atoms', Nature Materials, Vol. 13, No. 2, pp. 121-122, 2014.  公式リンク  
  
• Yang, D., Hartman, M.R., Derrien, T.L., Shogo Hamada, An, D., Yancey, K.G., Cheng, R., Ma, M., Luo, D.. DNA materials: Bridging nanotechnology and biotechnology, Accounts of Chemical Research, Vol. 47, No. 6, pp. 1902-1911, 2014.  公式リンク  
  
• Lee, J., Shogo Hamada, Hwang, S.U., Amin, R., Son, J., Dugasani, S.R., Murata, S., Park, S.H.. Quantitative analysis of molecular-level DNA crystal growth on a 2D surface, Scientific Reports, Vol. 3, 2013.  公式リンク  
  
• Hartman, M.R., Ruiz, R.C.H., Shogo Hamada, Xu, C., Yancey, K.G., Yu, Y., Han, W., Luo, D.. Point-of-care nucleic acid detection using nanotechnology, Nanoscale, Vol. 5, No. 21, pp. 10141-10154, 2013.  公式リンク  
  
• Lee, J., Shogo Hamada, Amin, R., Kim, S., Kulkarni, A., Kim, T., Roh, Y., Murata, S., Park, S.H.. Size-controllable DNA rings with copper-ion modification, Small, Vol. 8, No. 3, pp. 374-377, 2012.  公式リンク  
  
• Shogo Hamada, Murata, S.. Theoretical model of substrate-assisted self-assembly of DNA nanostructures, RSC Advances, Vol. 2, No. 19, pp. 7406-7412, 2012.  公式リンク  
  
• Shogo Hamada, Murata, S.. Algorithmic self-assembly of single-duplex DNA nanostructures, International Journal of Unconventional Computing, Vol. 7, No. 1-2, pp. 25-37, 2011.  公式リンク  
  
• Ayukawa, S., Kobayashi, A., Nakashima, Y., Takagi, H., Shogo Hamada, Uchiyama, M., Yugi, K., Murata, S., Sakakibara, Y., Hagiya, M., Yamamura, M., Kiga, D.. Construction of a genetic AND gate under a new standard for assembly of genetic parts, BMC Genomics, Vol. 11, No. SUPPL. 4, 2010.  公式リンク  
  
• Shogo Hamada, Murata, S.. Substrate-assisted assembly of interconnected single-duplex DNA nanostructures, Angewandte Chemie - International Edition, Vol. 48, No. 37, pp. 6820-6823, 2009.  公式リンク  
  
• Ayukawa, S., Kobayashi, A., Nakashima, Y., Takagi, H., Shogo Hamada, Uchiyama, M., Yugi, K., Murata, S., Sakakibara, Y., Hagiya, M., Yamamura, M., Kiga, D.. SYANAC: SYnthetic biological Automaton for Noughts and Crosses, IET Synthetic Biology, Vol. 1, No. 1-2, pp. 64-67, 2007.  公式リンク  
  

著書

• Shogo Hamada. Molecular Robotics, Encyclopedia of Robotics, Springer, Berlin, Heidelberg., Feb. 2021.
• 多田隈尚史, 葛谷明紀, 川又生吹, 村田智, 浜田省吾, 多田隈尚史, 野村慎一郎, 葛谷明紀, 小宮健, 川又生吹, 中茎隆, 角五彰, ほか全２２名. DNA分子デザインのすべて ～国際学生コンテストBIOMOD虎の巻～, DNA分子デザインのすべて ～国際学生コンテストBIOMOD虎の巻～, 情報計算化学生物学会（CBI学会）出版, May 2019.
• 小宮健, 瀧ノ上正浩, 田中文昭, 浜田省吾, 村田智. DNAナノエンジニアリング, ナチュラルコンピューティング・シリーズ（萩谷昌己，横森貴 編）, 近代科学社, Vol. 2, pp. (216 pages), 2011.

国際会議発表 (査読有り)

• Shogo Hamada, Satoshi Murata. A New Motif for DNA-based Nanostructures, Caltech Self-Replicating Chemical Systems Workshop, Mar. 2008.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• Masamune Morita, Miho Yanagisawa, Shogo Hamada, Shin-ichiro M. Nomura, Satoshi Murata, Masahiro Takinoue. Construction of self-assembled DNA nanostructures on lipid membrane surface, 第53回日本生物物理学会, Sept. 2015.
• 浜田省吾, 村田智. 核酸を用いた新規構造体モチーフ, 「細胞を創る」研究会 0.0, Mar. 2008.
• 浜田省吾, 村田智. 核酸を用いた新規構造体モチーフの設計, 第20回自律分散システムシンポジウム, pp. 193-196, Jan. 2008.

学位論文

• Substrate-assisted self-assembly of DNA nanostructures : design principles, theory and experiments,  Thesis,  Doctor (Engineering),  Tokyo Institute of Technology,  2011/03/26,   

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