論文

• Keisuke Yanagisawa, Takuya Fujie, Kazuki Takabatake, Yutaka Akiyama. QUBO Problem Formulation of Fragment-Based Protein–Ligand Flexible Docking, Entropy, MDPI, 26, Apr. 2024.  公式リンク  
  
• Takabatake K, Yanagisawa K, Akiyama Y.. Solving Generalized Polyomino Puzzles Using the Ising Model, Entropy, MDPI, Vol. 24, Issue (3), pp. 354, Feb. 2022.
• Takabatake K, Izawa K, Akikawa M, Yanagisawa K, Ohue M, Akiyama Y.. Improved large-scale homology search by two-step seed search using multiple reduced amino acid alphabets, Genes, 12, 9, 1455, Sept. 2021.  公式リンク  
  

国際会議発表 (査読有り)

• Kazuki Takabatake, Kazuki Izawa, Motohiro Akikawa, Keisuke Yanagisawa, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Improved Homology Search for Metagenomic Analysis by Two-Step Seed Search with Reduced Amino Acid Alphabets, The 10th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Science (ICBBS2021), Oct. 2021.  公式リンク  
  

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 高畠和輝, 伊澤和輝, 秋川元宏, 大上雅史, 秋山泰. 圧縮アミノ酸を利用した二段階のシード探索によるメタゲノム配列相同性検索の改良, 研究報告バイオ情報学（BIO）, Vol. 2020-BIO-61, No. 10, pp. 1-6, Mar. 2020.  公式リンク  
  

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